Vào một thời điểm nào đó không quá xa, tại New York – một trong những thành phố lớn bậc nhất nước Mỹ, dân chúng đang sống trong lo âu vì sự kìm kẹp của ba thế lực luôn tìm cách tiêu diệt lẫn nhau và gây đổ máu hòng đạt được mục đích đó. Ba thế lực này gồm quân đội chính phủ, lũ quái vật đột biến ghê tởm, hung hãn và một con người đột biến. Đó là bạn. Trong vai Alex Mercer, một kẻ đột biến với sức mạnh phi thường , một gã dị nhân với tốc độ ngang với một chiếc xe đua công thức 1, một nhân vật nguy hiểm muốn tiêu diệt tất cả để trả thù cho cuộc đời ngang trái của mình, bạn sẽ là ngôi sao trong trò chơi hành động phiêu lưu tự do của Radical Ent mang tên Prototype.Prototype mang đến cho người chơi một sự phấn khích đặc biệt khi tự mình hóa thân vào Alex bay nhảy trên khắp các con đường đẹp đẽ ở New York bằng tốc độ và sự nhanh nhẹn đến phi thường. Cụ thể, Alex có thể chạy tới 60 dặm/h và có những bước nhảy cao khủng khiếp (sánh ngang với loài ếch, tất nhiên khi so với kích thước nhỏ bé của chúng), anh nhảy từ chiếc ô tô này sang chiếc ô tô ở mãi góc phố phía xa một cách dễ dàng. Tuy vậy vẻ ngoài của Alex trông khá là thanh nhã và thư sinh chứ không giống những gã đột biến quái dị trong một số phim hành động.
Như đã nói, Alex là một kẻ rất nguy hiểm, trong khi “dạo chơi” qua những tòa nhà chọc trời hay những khu đô thị sầm uất, đôi lúc bản tính “quái vật” trong người hắn trỗi dậy và thật đáng thương thay cho những ai là nạn nhân của hắn. Qua một số hình ảnh ban đầu của trò chơi, nhà sản xuất đã đưa vào cả những chi tiết nhỏ nhất như việc những nạn nhân hối hả chạy trốn, kêu la thảm thiết khi bị Alex truy sát. Cả thành phố như rối tung – cảnh tượng dễ bắt gặp trong các bộ phim hành động giả tưởng. Những nạn nhân của Alex sẽ không thể thoát nổi cái chết kinh hoàng. Sau khi giết nạn nhân, Alex sẽ hấp thụ toàn bộ thể xác, DNA, kí ức của nạn nhân thậm chí cả dung mạo và cử chỉ của họ. Nói cách khác, nạn nhân của Alex không chết, họ sống trong cơ thể Alex. Thật kinh khủng!
Theo ý đồ của nhà sản xuất, Alex là một nhân vật chính phản diện đúng nghĩa., hắn ta không phải là người tốt hay đáng yêu gì cả. Đúng hơn, Alex là sản phẩm đáng kinh sợ nhất của một xã hội nhơ bẩn, tha hóa đến cùng cực. Hắn giống với Godzilla – con quái vật đã đi vào lịch sử phim điện ảnh, xuất hiện do sự quá đà của con người trong việc sử dụng vũ khí nguyên tử. Thế nhưng theo nhà sản xuất thì con quái vật ấy lại không được đề cập tới trong danh sách những “nhân vật” cấu thành nên Alex. Radical Ent đã tạo nên Alex từ rất nhiều nhân vật nổi tiếng trong điện ảnh như Darth Maul (gã người Sith trong loạt phim Star War) về sự điên khùng, xấu xa, Travis Bickle (gã lái xe kì quặc trong phim Taxi Driver) về độ quái gở và Hannibal Lecter (phim Sự im lặng của bầy cừu) về sở thích “ăn uống”. Thế nhưng Alex không sử dụng kiếm ánh sáng, cũng không có hàm răng bằng thép, hắn ta sử dụng chính cơ thể mình như là một thứ vũ khí tối thượng, mang dáng dấp của T – 1000 trong phim Kẻ hủy diệt 2.
Alex có thể biến cánh tay mình thành những lưỡi dao sắc bén, xẻ nạn nhân ra làm 2 như người ta cắt một miếng bánh mì, hay thọc đôi tay ấy xuống đất để tạo nên những bàn chông đá hất tung cả một chiếc xe tăng lên không trung. Alex tự bảo vệ mình bằng lớp áo giáp tự phát sinh trên cơ thể, cực kì chắc chắn, càng “ăn” nhiều người, lớp áo này càng dày thêm và những đòn tấn công của Alex sẽ càng mạnh hơn.
Điểm sáng tạo của game càng tăng cao khi nhà sản xuất tiết lộ, không chỉ có phá hủy, Alex còn có thể cướp lấy khí tài của quân đội và tự mình điều khiển. Điều này thể hiện bằng việc Alex nhảy lên một chiếc trực thăng Apache, “ăn” viên phi công, lấy kiến thức điều khiển máy bay của kẻ xấu số và sử dụng được luôn chiếc máy bay một cách thành thạo.
"> 
